モデルパラメータ

モデルの実行には何が必要か

病院パラメータ

地域の人口

病院の担当地域における総人口です。

これはSIRモデルの SS (感受性保持者)の初期値になります。感染者数と入院、集中治療(ICU)、人工呼吸器等を必要とする患者数の予測に影響を与えます。

Penn Medicineの場合、対象となるのはデラウェア郡、モンゴメリー郡、バックス郡、フィラデルフィア郡です。

病院の患者シェア(%)

地域の患者さんのうち、この病院に来院しやすい(地域の他の病院に比べて)人の割合です。

この値を推定する時に、地域の総病床数と比較したこの病院の病床数の割合を使用することができます。

注:病院のシェアは時間の経過とともに変化する可能性があります。

現在入院しているCOVID-19患者数

現在、この病院にCOVID-19で入院している患者数です。

この値は病院の患者シェアや入院率と組み合わせて用いられ、地域の感染者数の総計を推定します。

感染と接触のパラメータ

最初の入院症例が発生した日付(チェックボックス)

このチェックボックスは、この病院で最初の入院症例が発生した日付を指定する際に使います。

この日付は現在の入院患者数と合わせて、倍加時間と R0R_0 を計算するために使われます。

今日以前の倍加時間

注:このパラメータは、最初の入院症例のチェックボックスをチェックしていない場合にのみ有効です。

感染者数が2倍になるまでに必要な日数を表します。倍加率は介入がなかった場合の感染増殖率として適用されます。

人々の接触の現象やその他の公衆衛生上の介入は、社会的距離戦略パラメータの修正で表現します。倍加時間は R0R_0 に直接関連し、アウトブレイクの初期段階における新規症例の割合を増加させます。

アメリカ病院協会(AHA)は当初、倍加時間を7から10日と予測しました。倍加時間は実際の感染数に適用され、確認された症例数には適用されません。この違いは、AHAの倍加時間推定値と確認症例での観察された倍加時間(現在2から4日)の間に不一致があることを説明しているかもしれません。

社会的距離戦略(社会的接触の減少率%)

この地域で社会的距離戦略が採られなかった場合と比べ、社会的接触がどの程度減少しているかの推定値です。

このパラメータにより、政策(学校閉鎖やリモートワークなど)やその他の施策(手洗い、露出面の消毒を増やすなど)による感染の減少が、どのように新規感染の発生率を低下させるかを調査できます。

詳細は私たちのブログ記事や、Fergusonらの論文中の、社会的遠距離戦略の効果推定値をご覧ください。

深刻度パラメータ

入院患者率 %(総感染者数比)

入院が必要となる感染者の割合です。

この割合は、入院した COVID-19 患者数、および病院の患者シェア(%)とともに用いることで、推定感染者数を示します。

Verityらの論文は、感染者の約5%が入院を要することを示唆していますが、年齢調整の方法も同論文内で提供されていますので、母集団に合わせて調整したい場合はVerityらの論文を参照してください。

注:地域によって必要な入院期間が異なる可能性があるため、この数字には多くの不確定要素が含まれます。

集中治療患者率 %(総感染者数比)

集中治療室(ICU)での治療が必要となる感染者の割合です。

同様にVerityらの論文を参照しており、入院患者の約30%を想定しています。地域毎の治療のばらつきによる不確定要素に注意してください。

人工呼吸患者数 %(総感染者数比)

人工呼吸器での治療が必要となる感染者の割合です。

同様にVerityらの論文を参照しており、入院患者の約30%を想定しています。地域毎の治療のばらつきによる不確定要素に注意してください。

感染力を持つ日数

感染者が他人への感染力を維持する日数です(感染者の症状の有無を問いません)。

これはSIRモデルではガンマ( γ\gamma )で表されます。

滞在日数

互いに独立して扱われる、3つの異なる滞在期間の尺度が提示されています。これらの尺度は互いに加算されません。これらの3つのパラメータを足し合わせることがないようにしてください。

平均入院日数

COVID-19患者の平均入院日数です。

これは高度治療を受けている受けていないに関係なく、全ての入院しているCOVID-19の患者が含まれています。

初期値は、Penn Medicineの4施設でケアした、5年間に約1万人の呼吸不全患者の全入院期間データに基づいています。治療手順が異なることに対して明確な情報がないため、他国でのCOVID‐19治療患者に関する内部データを利用しました。

平均集中治療日数

COVID-19患者のうち、集中治療室でのケアが必要となる平均日数です。

これには、人工呼吸治療を受けている患者も含まれます。

初期値の9日は、Penn Medicineの4施設でケアした、5年間に4000人弱の集中治療を必要とした呼吸不全患者の処置期間データに基づいています。治療手順が異なることに対して明確な情報がないため、他国でのCOVID‐19治療患者に関する内部データを利用しました。

人工呼吸治療日数

COVID-19患者のうち、人工呼吸器でのケアが必要となる平均日数です。

初期値の10日は、Penn Medicineの4施設でケアした、5年間に2000人弱の人工呼吸器サポートを必要とした呼吸不全患者2000人弱の処置期間データに基づいています。治療手順が異なることに対して明確な情報がないため、他国でのCOVID‐19治療患者に関する内部データを利用しました。

表示パラメータ

予測する日数

グラフのX軸に表示する日数です。

注:感染者のピークが最終予測日の後に発生する場合、ピークとして報告された数値は不正確になります。その場合は、正しいピーク値を見るために、予測する日数を増やしてください。

グラフのY軸に固定値を指定(チェックボックス)

このチェックボックスは、Y軸の最大値に固定値を設定する場合に用います。

初期設定では、Y軸の最大値は予測のピークの値に応じて自動で調整されます。

現在の日付

予測の行った時を示す年/月/日形式での日付です。

グラフには、時間の関係性がわかるようこの日付のところに縦線が描画されます。

初期値は今日の日付です。最新の既知データが今日のものでない場合や、現在のモデルで過去の推定を再実行する場合には、それ以前の日付を使用することができます。

その他の参考文献

パラメータへの入力を選ぶための参考文献リストは、すばらしいMIDASの編集物を参照してください。

原文

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